[STEM], В коде с топика нет сохранения изображения
графические функции php работают в оперативке, если это возможно

Maksamka, в phpinfo() гляньте куда сессии пишутся

Maksamka, папки вообще не нужно трогать
сессии по умолчанию "падают" в mod-tmp
Удалив папку logs Вы "отломали" модуль журнала запросов
Логи можно было просто очистить через панель в журнале запросов
mod-tmp в принципе никогда не переполнялась, но её можно было содержимое почистить

Maksamka, Папка сессий есть?
Возможно папочку случайно удалили

Квота дисковая не кончилась?
при превышении квоты блокируют запись на диск