Дальше, всё, что Вам нужно - это поставить его в cron, например, раз в сутки в 2 часа ночи. Тогда если что-то с Вашим сайтом случится, архив всегда можно будет выкачать с сервера и восстановить сайт из бэкапа.

                        
<?php

  set_time_limit(0); // Убираем ограничение на максимальное время работы скрипта

  /* Массив с именами баз данных (имя базы данных можно посмотреть в phpMyAdmin) */

  $db_names = array();

  $db_names[] = "db1";

  $db_names[] = "db2";

  

  /* Массив с именами директорий, в которых лежат все файлы сайта */

  /* ВАЖНО: Все пути должны быть физическими и идти от корня сервера. Точный физический путь можно посмотреть через phpinfo() */

  $source_dirs = array();

  $source_dirs[] = "/home/mysite1.ru";

  $source_dirs[] = "/home/mysite2.ru";

  

  $offset_dirs = strlen("/home/"); // Служебная переменная, служащая для устранения лишних папок в архиве

  

  /* Параметры подключения к базе данных */

  $host = "localhost";

  $user = "root";

  $password = "";

  

  $dump_dir = "/home/backup"; // Директория, куда будут помещаться архивы

  $delay_delete = 35 * 24 * 3600; // Время в секундах, через которое архивы будут удаляться

  $filezip = "backup_".date("Y-m-d").".zip"; // Имя архива

  

  deleteOldArchive(); // Удаляем все старые архивы

  

  if (file_exists($dump_dir."/".$filezip)) exit; // Если архив с таким именем уже есть, то заканчиваем скрипт

  

  $db_files = array(); // Массив, куда будут помещаться файлы с дампом баз данных

  

  for ($i = 0; $i < count($db_names); $i++) {

    $filename = $db_names[$i].".sql"; // Имя файла с дампом базы данных

    $db_files[] = $dump_dir."/".$filename; // Помещаем файл в массив

    $fp = fopen($dump_dir."/".$filename, "a"); // Открываем файл

    $db = new mysqli($host, $user, $password, $db_names[$i]); // Соединяемся с базой данных

    $db->query("SET NAMES 'utf-8'"); // Устанавливаем кодировку соединения

    $result_set = $db->query("SHOW TABLES"); // Запрашиваем все таблицы из базы

    while (($table = $result_set->fetch_assoc()) != false) {

      /* Перебор всех таблиц в базе данных */

      $table = array_values($table);

      if ($fp) {

        $result_set_table = $db->query("SHOW CREATE TABLE `".$table[0]."`"); // Получаем запрос на создание таблицы

        $query = $result_set_table->fetch_assoc();

        $query = array_values($query);

        fwrite($fp, "n".$query[1].";n"); // Добавляем результат в файл

        $rows = "SELECT * FROM `".$table[0]."`";

        $result_set_rows = $db->query($rows); // Получаем список всех записей в таблице

        while (($row = $result_set_rows->fetch_assoc()) != false) {

          $query = "";

          /* Путём перебора всех записей добавляем запросы на их создание в файл */

          foreach ($row as $field) {

            if (is_null($field)) $field = "NULL";

            else $field = "'".$db->real_escape_string($field)."'"; // Экранируем значения

            if ($query == "") $query = $field;

            else $query .= ", ".$field;

          }

          $query = "INSERT INTO `".$table[0]."` VALUES (".$query.");";

          fwrite($fp, $query);

        }

      }

    }

    fclose($fp); // Закрываем файл

    $db->close(); // Закрываем соединение с базой данных и переходим к следующей

  }

  

  $zip = new ZipArchive(); // Создаём объект класса ZipArchive

  $allfiles = array(); // Массив со списком всех файлов, которые будут помещены в архив

  if ($zip->open($dump_dir."/".$filezip, ZipArchive::CREATE) === true) {

    for ($i = 0; $i < count($source_dirs); $i++) {

      /* Рекурсивный перебор всех директорий */

      if (is_dir($source_dirs[$i])) recoursiveDir($source_dirs[$i]);

      else $allfiles[] = $source_dirs[$i]; // Добавляем файл в итоговый массив

      foreach ($allfiles as $val){

        /* Добавляем в ZIP-архив все полученные файлы */

        $local = substr($val, $offset_dirs);

        $zip->addFile($val, $local);

      }

    }

    /* Добавляем в ZIP-архив все дампы баз данных */

    for ($i = 0; $i < count($db_files); $i++) {

      $local = substr($db_files[$i], strlen($dump_dir) + 1);

      $zip->addFile($db_files[$i], $local);

    }

    $zip->close();

  }

  

  for ($i = 0; $i < count($db_files); $i++) unlink($db_files[$i]); // Очищаем массив db_files

  

  /* Функция для рекурсивного перебора и сохранения всех файлов и папок в массив, который затем возвращается */

  function recoursiveDir($dir){

    global $allfiles;

    if ($files = glob($dir."/{,.}*", GLOB_BRACE)) {

      foreach($files as $file){

        $b_name = basename($file);

        if (($b_name == ".") || ($b_name == "..")) continue;

        if (is_dir($file)) recoursiveDir($file);

        else $allfiles[] = $file;

      }

    }

  }

  

  /* Функция для удаления всех старых архивов */

  function deleteOldArchive() {

    global $dump_dir;

    global $delay_delete;

    $ts = time();

    $files = glob($dump_dir."/*.zip");

    foreach ($files as $file)

      if ($ts - filemtime($file) > $delay_delete) unlink($file);

  }

?>