твои массивы
$array1 - массив идов пройденных квестов;
$array2 - массив идов всех квестов;
foreach($array2 as $val):
if(!in_array($val, $array1)):
$array3[]=$val;
endif;
endforeach;
получим $array3 - массив идов не пройденных квестов;
что тут еще может быть не понятного?

Slic, $array1 - массив идов пройденных квестов;
$array2 - массив идов всех квестов;
foreach($array2 as $val):
if(!in_array($val, $array1)):
$array3[]=$val;
endif;
endforeach;
$array3 - массив идов не пройденных квестов;