Я тоже долго мучал себя этим вопросом, и вот ответ: PDO позволяет работает с разными БД, и проект можно будет легко перенести на другую бд. И код у него мудрее. Если работаешь только с MySQL - то явно надо использовать MySQLi. Она работает (хоть на немного) быстрее PDO, и код легче. "mysqli с процедуркой ооп" - вот этого не понял.. MySQLi ладит с ООП.