Если будешь ставить редиректы, то ссылки оставь старые (без чпу) пока всё не переинднксируется, т.к. поисковики не будут проверять старые адреса на редиректы и тупо посчитают за дубль. Была такая фигня, после перехода на чпу сайт из топа вылетел, причем по всем запросам