Odo Veiz, В крупных проектах не используют MySQl, PostgreSQL, Oracle и др. У них свои базы данных.

Для автора на будущие и PostgreSQL достаточно будет.

Основным преимуществом MySQLi является то, что при помощи предварительно объявляемых операторов, могут быть предотвращены так называемые SQL-инъекции.

Лично моё мнение: Работай с PDO.

Если ты будешь работать с MySQLi и твой проект пойдёт в гору, то тебе однозначно придётся мигрировать на другую базу данных и переписывать весь проект.
С PDO такого не будет, т.к PDO предлагает единые методы для работы с различными базами данных.