То есть обновление каждую секунду? Каждую секунду дёргается сервер?
Можно через одной функции сделать по 8-9 сек.
Думаю, этого достаточно , чтобы проверять новые сообщение и уведомление.
а дальше на усмотрение кодера.
А если эту вашу функцию начнут пихать везде и всюду?
Без .htaccess работать на php почти не возможна(Нельзя будет ограничить доступ к папке и файлу; Незьзя будет перекидова с однго пути на другой. например: /users/user.php?id=1 на /id1).
Пара моих сайтов уже работают без хитач.
Ты это серьезно? отсутствие Хитача приводит к иньекции ?
Хахахахахха - хум
А SEO не будет, автор сам приведёт посетителей.
Кстати мобильные web-сайты это m.vk.com, m.ok.ru и таких много сейчас.
Тот же вап, только с обильным присутствием javascript. jquery, ajax всё в работе как на web сайтах.
А то что адаптивные сайты не удобные, это проблема разработчиков шаблонов, которую хорошо было бы решить.
хостинг без htaccess это не реанимация вапа, это харакири. на уровне скрипта прописывать точку входа это извращение.
Правила: 
