еще один недостаток - файлы нужно инклудить по мере надобности, а в данном случае будут постоянно подгружаться все файлы.

а при регистр глобалс он вообще счастье будет для шелла.

это типичное извращение.

недостатки.
1 будет грузить сайт
2 код не безопасен так как инклудит все подряд из папки.

я написал например классы, это не значит что надо подключять тупо классы

ужс...

Файлы с классами надо подключать по запросу, то есть тогда когда они нужны и как раз для этого была придумана например функция __autoload. Еще можно создать свою функцию для автоподключения классов и зарегистрировать её при помощи spl_autoload_register.
А в твоем случаи, при каждом запросе будут инклудится все классы какие есть, а использоваться только часть из них.

Например?

function __autoload($classes){
include $classes.\'.php\';
}
можно и так, но эта функция в некоторых моментах неподходит

Для подключения классов есть autoload

- не есть хорошо. Да и полезн будет для гкодеров ток