в $link указывайте прямую ссылку до файла и готово скрипт проверит ваш jar файл.
<?
$link = '../jar/game.jar';
$manifest = file_get_contents("zip://".$link."#META-INF/MANIFEST.MF");
if(preg_match('/(messaging|sms|send|connector.sms)/i',strtolower($manifest))){
$a = '<span style="color: #FF0000;"><b>Внимание:</b> файл содержит функцию отправки SMS.</span><br/>';
}
?>