mapper, YAML как это принято в symfony. =)

Но в phpixie простые массивы с PHP обёрткой для них.

mapper, Нулик Один Нулик Нулик Один.

Миледи, Ну, я бы не стал называть хранение конфигурации в PHP плохим методом) Это вполне хороший вариант, но не всегда)

donttime, Зачем в функции collection перебирать массив, для простой операции слияния?

Учи матчасть) php.net/manual/ru/function.array-merge.php

И я может чего не знаю, но разве твой класс, для конфигурации не умеет работать с конфигурацией?

То есть по задумке, ты каждый параметр должен ранее установить сам... у тебя не класс конфигов, а простой реестр.

Миледи, Для подключения лучше тогда при такой логике юзать require.

При использовании require в случае отсутсвия файла, выполнение программы прекрашается.

Да и хранить конфигурацию нативно в PHP как-то не кошерно =)